un chasseur de microbes sur appel au monde, découverte nouvelles

Nouveaux Microbes Outils d’identification plus rapide

Places Droite, Droite Temps

Ian Lipkin, M.D., trouve des aiguilles dans les meules de foin dans le monde entier des maladies infectieuses. L’utilisation d’outils de précision que lui et ses collaborateurs continuent de développer et parfait, il scouts, pistes, sacs et étiquettes des virus et des bactéries.

Il est sur appel sur au moins cinq continents.

L’identité Borna

Dr Lipkin, professeur et directeur de recherche de l’Université Columbia, est parmi les maladies infectieuses notables enquêteurs dans une génération remarquable de découverte. En 1999, il a dirigé l’étude qui a identifié le virus du Nil occidental comme la cause d’une épidémie d’encéphalite à New York, et en 2003, il a développé un test de diagnostic rapide pour le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) et a pris 10.000 des kits avec lui en tant que invité conseiller du Chineseernment.

Virus du Nil occidental et le SRAS

L’an dernier, le Dr Lipkin a identifié un nouveau virus qui a tué trois receveurs de greffes d’organes en Australie, a déterminé sa source, et résolu un mystère médical inquiétant.

“Il est un microbe chasseur moderne», dit collègue Larry Sturman, M.D., Ph.D., directeur du Centre Wadsworth du Département d’Etat de New York de la Santé. “Il est quelqu’un qui est intéressé à découvrir les causes des maladies mondiales, et il a des collaborations partout dans le monde.”

Les références

Les scientifiques ont identifié environ 100 nouvelles maladies infectieuses depuis 1990, selon une récente étude publiée dans Nature. Pour faire de pointe de sorte qu’ils ont souvent utilisé les avancées technologiques dans des domaines tels que la génomique et la protéomique. Les progrès ont été stimulés par le long de nouvelles approches de personnes comme le Dr Lipkin.

“Il est extrêmement créatif», dit Anthony S. Fauci, M.D., directeur de theernment, qui finance une partie de son travail. Dr Lipkin a été impliqué dans les centres régionaux de theernment d’excellence pour la biodéfense et les maladies infectieuses émergentes pour les six dernières années. “Non seulement il a mis au point la technologie à haut débit, il a également découvert de nombreux nouveaux microbes, et forme d’autres à faire de même.”

la technologie à haut débit permet aux scientifiques d’effectuer des centaines ou des milliers de tests impliquant des gènes ou des protéines et recevoir des résultats en quelques minutes, heures ou jours plutôt que des semaines, des mois, voire des années, par le biais d’autres méthodes.

A Columbia, où il est professeur John Snow Epidémiologie et directeur du Centre pour les maladies infectieuses et immunitaires à l’École de santé publique Mailman, pratiquement chaque collègue que le Dr Lipkin rencontre est intéressé à partager une partie de leur travail afin de puiser dans son.

Par exemple, son travail avec le SRAS a donné lieu à une subvention qui lui a permis d’apporter environ 30 personnes de partout dans le monde à Columbia pour la formation. «Ils arrivent souvent avec des matériaux de leurs institutions d’origine, nous travaillons eux, et écrire des documents,” explique le Dr Lipkin. «Voici comment nous avons découvert 30 nouveaux agents dans la dernière année seulement. Nous ne pouvons pas les écrire assez vite. Il est une série incroyablement productive des collaborations “.

Et à chaque tour, le Dr Lipkin pense comment appliquer ces technologies à travers le monde, dans les laboratoires et sur le terrain.

«Notre objectif est d’apprendre aux gens à pêcher au lieu de la pêche pour eux», dit-il, ajoutant que son groupe à la Columbia a établi un réseau de plus de 10 sites à travers le monde où les chercheurs partagent régulièrement des idées et des résultats en Chine, en Afrique, Australie, Amérique du Sud, et Amérique du Nord.

première grande interruption de carrière du Dr Lipkin est venu en 1981 quand il a commencé à travailler à l’Université de Californie, San Francisco (UCSF). Il rappelle premières expériences d’emploi qui lui ont enseigné diverses compétences-professionnel et l’a présenté à trois lauréats du prix Nobel.

Pendant l’écoute d’une conférence sur le kuru En 1976 Nobel Carleton Gajdusek, M.D., le Dr Lipkin, dit-il “est devenu très intrigué par l’idée que nous avions besoin de développer de meilleurs moyens de découverte de la maladie et le diagnostic.”

Au moment où il achevait sa résidence médicale en neurologie à l’UCSF, Stan Prusiner, M.D., a été la définition de prion, l’agent roman considéré comme responsable de kuru et d’autres encéphalopathies spongiformes, et le VIH commençait tout juste à émerger. Tout en travaillant dans une clinique de San Francisco, le Dr Lipkin a vu les effets du VIH de première main.

«Je suis fasciné par le concept qu’une maladie infectieuse pourrait avoir un effet profond sur le système nerveux central», explique le Dr Lipkin. Ce fut son deuxième moment clé de la reconnaissance de la mission de la santé publique mondiale, quelque chose de très important pour lui. premier aperçu du Dr Lipkin est venu pendant l’école de médecine tout en travaillant dans une clinique Indian Health Service dans l’Oklahoma. “Voilà où je fus présenté à la façon dont les disparités de santé peuvent influer sur les maladies infectieuses», se souvient le Dr Lipkin.

Il a quitté l’UCSF en 1984 pour The Scripps Research Institute et une bourse de neurovirologie sous la direction de Michael Oldstone, M.D. Dr. Oldstone récemment rappelé que son nouveau compagnon lumineux avait aucune expérience dans un laboratoire de recherche quand il est arrivé. «L’énergie énorme, intelligent, et un charme sur lui», dit le Dr Oldstone. “Mais jusqu’à ce moment-là son travail était surtout tout clinique.”

Dr Oldstone et ses collègues ont enseigné les techniques Dr Lipkin en immunobiologie virale. “Il est devenu très compétent», dit le Dr Oldstone, et ces techniques est devenu la base de la première découverte scientifique unique du Dr Lipkin.

En 1985, le Dr Lipkin se souvient la lecture d’une étude en sciences au sujet d’un agent inconnu qui a causé l’encéphalite chez les chevaux, mais était liée à un trouble bipolaire et la dépression chez l’homme. Il a creusé et a passé les quelques années à venir explorer ce sujet sur son propre temps, en dehors de ses responsabilités avec le Dr Oldstone.

En 1989, il a identifié l’agent, le virus Borna, par une méthode de main-d’œuvre connue sous le nom soustractive clonage d’ADNc. Ce fut la première fois purement méthodes moléculaires ont été utilisées pour identifier un agent infectieux.

L’étude, dit-il, était le précurseur de ses recherches actuelles, bien que ce took3 ans, puis probablement prendre 1 semaine aujourd’hui, il estime.

Les études Borna ont ouvert une autre porte pour le Dr Lipkin-la recherche a attiré l’attention de Joshua Lederberg, Ph.D., qui a partagé un prix Nobel en 1958 et est devenu un mentor et un ami. Dr Lipkin a prononcé un éloge funèbre lors des funérailles de Dr. Lederberg en Février de 2008.

En 1991, le Dr Lederberg a aidé le Dr Lipkin gagner un prix Pew Scholar, qui lui a fourni quatre ans de financement de la recherche sans restriction, un énorme coup pour un jeune scientifique.

Le financement a permis le Dr Lipkin d’élargir ses études de virus Borna dans un nouveau contexte, l’Université de Californie, Irvine. Aussi tout à Irvine, le Dr Lipkin a pris connaissance du taux de cas non diagnostiqués de 70 pour cent dans les études de l’encéphalite.

Pour aider à améliorer les tests de diagnostic de l’encéphalite, le Dr Lipkin a décidé de comparer les nombreux virus qui ont causé l’encéphalite. Son travail a fusionné deux types de réaction en chaîne par polymérase (PCR), en prenant la technologie de réplication de l’ADN qui était encore nouvelle et l’adapter pour de nouvelles utilisations. “Il était fastidieux,» dit-il, “mais il vous a permis de faire des choses pas possibles avec la PCR traditionnelle.”

Il a également établi son expertise avec des cas d’encéphalite non diagnostiqués.

Dans les 48 heures, il a dit qu’il connaissait la cause n’a pas été le virus de l’encéphalite de Saint-Louis. En 1999 fermé, le Dr Lipkin a publié deux documents sur les études de New York, à la fois réduire progressivement le diagnostic à virus du Nil occidental-les premiers cas identifiés aux États-Unis.

Cette découverte a incité Britannique à recruter le Dr Lipkin en 2002 pour commencer son programme de santé publique sur les maladies infectieuses émergentes mondiales.

Aujourd’hui, le Dr Lipkin dit qu’il se sent comme un conducteur chanceux menant un orchestre symphonique d’environ 35 scientifiques. Il fait rarement le travail de banc dans le laboratoire plus qui est pour les jeunes, des solistes énergétiques d’aujourd’hui qu’il mentors. Britannique aussi lui a fourni plusieurs pistes de recherche supplémentaires, y compris une étude de cohorte de naissance intrigante en Norvège et collaborations en Chine. L’étude de cohorte de naissance est suivi de l’information de santé sur quelque 100.000 enfants et leurs parents, dans l’espoir d’identifier rétrospectivement les nouveaux facteurs qui déclenchent des maladies.

La relation avec la Chine a commencé peu après le Dr Lipkin est arrivé à Columbia lorsque le SRAS a émergé. Le Chineseernment recherché Dr Lipkin pour l’aide après avoir entendu parler de son travail de deux étudiants chinois à Columbia. Il a immédiatement pris un avion pour Pékin et a développé une présentation en cours de route. “Il était politiquement sensible et scientifiquement important”, dit-il, rappelant maladroits, des réunions télévisées où les dirigeants militaires chinois attendaient des résultats.

«On me demandait d’illustrer la puissance de la science, qu’il pourrait rétablir la sécurité à la population générale. Ce fut une leçon d’humilité. ”

Dr. Sturman du Centre Wadsworth décrit affectueusement le côté comique du Dr Lipkin tout en partageant des souvenirs de la célébration de la Journée du Nouvel An à la résidence Lipkin à Manhattan. “Il est un homme de famille qui semble apprécier les invités d’hébergement», dit le Dr Sturman. “Et ce jour-là nous avons vraiment l’a vu dans l’action qu’il gère tout: la cuisine, la nourriture, le vin, et les invités.”

Apparemment, dans la cuisine ou dans le laboratoire de la haute énergie et l’enthousiasme que le Dr Oldstone et beaucoup d’autres collègues ont décrit encore conduire le Dr Lipkin.

“La rapidité avec laquelle il a fait de la recherche est vraiment remarquable», dit le Dr Sturman. “Lui et son ordinateur portable ne peut pas être séparé. Il travaille toujours, écrire quelque chose, ou réorganiser les diapositives pour ses entretiens. ”

Dr Lipkin dit qu’il est impossible pour lui de prendre de vraies vacances, donc il ne fait pas. Il dispose d’une cabine sur un lac voisin où il va aussi souvent que possible “pour obtenir mon cerveau remettre en forme» lors d’une randonnée ou le kayak. Il aime aussi les musées: “Même une heure ou deux au Met ou moderne est réparatrice», dit-il, se référant au Metropolitan Museum of Art et le Museum of Modern Art.

Mais même pendant une conversation détendue, son esprit est au travail en essayant d’établir des liens pertinents pour travailler. Tout en discutant de l’avenir de son test de diagnostic, le Dr Lipkin se déplace brusquement la conversation remonte à 1983 et son travail à San Francisco.

Il parle de deux patients atteints du VIH qu’il a examinés, chacun avec un système nerveux enflammé, et comment il les a traités avec succès et finalement identifié le SIDA associé neuropathie inflammatoire.

Comment est-ce pertinent pour son travail actuel et futur? Dr Lipkin mentionne Austin, Minnesota. Voilà où, selon les bulletins de nouvelles de début de cette année, une douzaine de salariés dans un abattoir de porcs ont été écoeurés par une mystérieuse maladie. Inhaler les particules en suspension de cerveau de porc est une cause possible, et les symptômes du patient sont assez semblables à ceux de 1983 patients du Dr Lipkin avoir attiré son attention.

“Le plus souvent nous pensons sur les maladies infectieuses comme étant aiguë,” explique le Dr Lipkin. “Tout le monde comprend la pneumonie, la diarrhée et les infections cutanées. Mais cela est que la pointe de l’iceberg. “Infections, dit-il, peut causer toute une gamme de maladies par l’induction de la croissance cellulaire anormale, l’auto-immunité, immunosuppression, ou d’interférence avec le développement normal. “Le même agent peut avoir des effets différents selon les individus», explique le Dr Lipkin.

Parfois, un agent infectieux peut être disparu au moment où les symptômes se développent, dit-il, ajoutant que certaines études suggèrent que certaines formes de maladie mentale peuvent être liés à l’exposition dans l’utérus. «Nous arrivons à voir certaines maladies infectieuses comme une intersection malheureuse de gènes, l’environnement et le calendrier», explique le Dr Lipkin.

Puis il décrit son “arbre de vie” approche pour comprendre la maladie. En utilisant les différentes techniques qu’il a contribué à développer, et y compris des facteurs tels que le changement climatique, la distribution des vecteurs, et les tendances démographiques, le Dr Lipkin espère au moins offre “une hypothèse infectieuse» pour toute affection. Le fruit à faible pendaison, dit-il, sont des choses comme l’encéphalite et la diarrhée où un agent infectieux est attendu avec la maladie. Plus haut de l’arbre sont, par exemple, des choses comme le cancer.

«Imaginez si nous avions eu ces outils dans les années 1970», dit-il. «Nous aurions pu être en mesure de prédire quelque chose comme le VIH.”

A New arénavirus dans un cluster de maladies Transplant-Associated Fatal

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